1、要防治辣椒顶部萎焉，首先要找到准萎焉的原因，比如说病害、虫害、水大沤根、干旱缺水、高温危害、低温冻害等。如果萎焉的原因找不准，不仅不能解决辣椒萎焉的问题，反而会延误防治最佳时机，或加重辣椒萎焉危害而减产。
2、辣椒生理性病害的防治方法在施肥时，尽量多施腐熟有机肥、磷钾肥，最好实行测土配方施肥，控制使用好氮肥；在浇水时，要根据辣椒生长不同生长阶段对水分的需求量大小进行灵活浇小水，除了苗期和结果期外，生育期要保持土壤湿度干燥，以防湿度过大滋生病虫害或导致辣椒根系缺氧窒息腐烂等。
3、合惯栲狠疲理管理在管理上，一方面做好整枝打杈、老黄叶摘除等管理，同时要做好叶螨、蓟马、蚜虫、烟青虫、棉铃虫、菜蛾等病虫害的防治，尤其要重防根结线虫的危害；一方面要做好持续阴雨天气以及天气骤晴后的防护管理，建议通过叶面喷施磷酸二氢钾、芸苔素内酯、氨基酸叶面肥及全营养型叶面肥的方法，来为作物补充养分、平衡生理代谢，进而刺激辣椒健康茁壮的生长。
