1、意思不同
最小对立体：如果两个词，除了出现在同一位置上的一个音以外，其余的音都相同，那么这两个词就构芤晟踔肿成了一个最小对立体。音位对立：两个完全不同的音素，构成音位对立。如音位/p/和/b/在音素[pit]和[bit]中是属于音位对立。
2、两者针对的对象不同
最小对立体和音位对立虽是两种不同概念，但是本质是找出语言中的音位，只是对象有所不同，最小对立体是针对两个词，而音位对立则是针对两个音素。
3、语音特征不同
最小对立体就是两个对立的音位只有一个语音特征不同，其他语音特征都相同。比如pate和bate中的[p]和[b]，都是辅音、都是塞音、都是双唇音，都是……，但有一点不一样，前者是清辅音，后者是浊辅音。
音位对立就是指能够造成意义差别的那些语音差别，比如在mate、late、hate、pate、bate、date、gate、kate中，每一个单词的第一个辅音都能造成语音差别，因此都形成音位对立。
相反，[m]和[p]就不能形成最小对立体，因为它们虽然都是辅音、都是唇音，但至少有两个语音特征不同：除了清浊不同外，一个是鼻音，一个是塞音。
参考资料来源：百度百科-最小对立体