本经验简要介绍使用Origin进行常规小提琴图、分边小提琴图的绘制。需要注意:软件版本至少为Origin2018版本,新版本如Origin2019更好。如未下载,可参考下列经验引用。
工具/原料
Origin2018或更高版本,更低版本无此功能。
PC,以Windows操作系统为例
Part1:常规小提琴绘制
1、第一步,导入数据。1.V1、V2、V3、V4为4个变量/特征,AD假设为Alzheimer患者(50例),Control则为对照组(50例)。2.数据为随机生成的数据,不具备任何科学实意。两组的数据可以不相等。3.下图为局部/全部数据,分为常规小提琴图格式(本节使用)、分边小提琴格式(第二节将使用)。
2、第二步,选择输出小提琴图类型。1.请按照图示进行操作,各种常规类型小提琴图见后文。2.获得目标小提琴类型对应图形后,需要进行后期调整,否则不适于论文中。
3、第三步,图形调整,类型1:Violin Plot。1.双击图中小提琴图,修改参数(各参数意义见下一步)。2.修改参数、修改后的结果如图所示。其他参数不做过多说明,请自行探究。
4、第三步,图形调整,类型2:Violin with box。1.Group菜单栏下的各参数意义见图中指示,图中以第V2_Control变量进行说明。
5、第三步,图形调整,类型3:Violin with Point。
6、第三步,图形调整,类型4:Violin with Quantile。
7、第三步,图形调整,类型5:Violin with Stick。
8、第三步,图形调整,类型6:Half Violin。
Part2:分边小提琴绘制
1、第一步,数据设置。1.用于绘制分边小提琴图的数据最后一列必须是组别,否则不能准确绘制分边小提琴图。如图中粉色框所示。
2、第二步,绘制分边小提琴图。
3、第三步,修改图形。1.Origin的分边小提琴图的默认参数可见下图1。2.点击Distribution按钮下面的相关按键进行填充颜色、线型等修改即可。3.通常只使用两种颜色进行区分AD和Control组,否则容易失去分边意义。