1、身份不同：
通过公务员考试进入法院的聘任制书记员是公务员身份。法院向社会公开招聘的聘任制书记员为合同工身乍鋈继琪份。
2、福利待遇不同：
通过公务员考试进入法院的聘任制书记员享受国家公务员福利待遇（按照同工同酬的原则）。法院向社会公开招聘的聘任制书记员只享受劳动合同待遇。
3、晋升机会不同：
对已通过公务员考试和司法考试的聘任制书记员，应积极协商组织人事部门按委任制公务员管理，业务能力突出的可经考核择优转任为法官；对工作不称职的聘任制书记员，要按照规定予以解聘。
扩展资料
聘任制书记员是法院系统根据《公务员法》、《人民法院书记员管理办法（试行）》等有关法律政策规定，实行聘任制是所产生的书记员职位。
根据《公务员法》、《人民法院书记员管理办法（试行）》等有关法律政策规定，法院系统书记员职位实行聘任制。
法院系统书记员（聘任制）是人民法院干部队伍的重要组成部分，除法律、法规和聘任合同规定外，人民法院书记员享受公务员的各项待遇。
聘任制书记员实行合同管理，由人民法院与受聘人依照有关法律订立聘任合同，在合同有效期内，人民法院与受聘人双方履行合同规定。
参考资料来源：百度百科--聘任制书记员