1、首先，蓝藻是养鱼池塘中常见的藻类之一，数量多时易对养殖生产产生危害。 鱼类不喜摄食蓝藻，且难以消化，会影响鱼类对其他饵料生物的利用。
2、然后，水体生物多样性急剧降低。蓝藻大量繁殖恶化了池水的通风及光照条件，抑制了鱼螃赎瘵簟池中浮游生物有益种类的生长繁殖，阻碍水藻的光合作用，挤占鱼类易消化藻类的生存空间，使鱼池中的丝状藻和浮游藻等不能合成本身所需要的营养成分而死亡。
3、然后，蓝藻大量繁殖以及死亡藻类的分解，消耗了大量的溶解氧，导致水体缺氧甚至无氧，从而易导致养殖水体发生泛塘。
4、然后，蓝藻大量死亡时容易败坏水质，可产生藻毒素、大量羟胺及硫化氢等有毒物质直接危害水生动物。
5、然后，死亡的蓝藻释放大量的有机质，刺激化能异养细菌的生长，其中部分对鱼类来说是致病菌，导致继发感染细菌性疾病。
6、最后，蓝藻大量繁殖时，散发腥臭味，影响水体的正常功能。 发生蓝藻水华时水体的理化指标常常超出水生动物的忍可以受限度，从而引起死亡。
