1、战斗模式也不同于以往的回漫画讲解《穹之扉》系统与战斗合制，采用了"交错式时间战斗"(Cross Dynamic Time Battle)模式，简称CDTB，让战斗增添了许多变化，例如本次新增的"多变控制 – 战阵系统"。CDTB模式说明:战场上每个角色包括敌人拥有自己的冷却时间，当冷却时间抵达时可以下达任何命令，下达后即刻执行;在等待表演的时间中，可以任意切换至其他角色，对其下达命令，下达后也无需等待即刻执行。另外，下达命令后冷却时间即重新计算，而不是等待表演后重新计算。在等待时间过程中，将会自行发动无需命令的动作，如移动、蓄力、闪避、格档等等。"多变控制"说明:指玩家在战斗中可以自由切换操作的角色，或者是专心操作自己所选定的角色，其余角色将由AI代为操作。完美的单角色控制，灵活的多角色切换，轻松的全角色代管，均可以随时于战斗中自由设置。"快捷键"说明:游戏中的战斗快捷键分为三大种类:①攻击快捷:进入战斗后系统会自动选定一个目标，点选在画面下方左边有官方COS定妆照十格字段的某一格，将可发动攻击。②物品快捷:在画面下方右边有五格字段均为物品快捷格，点选某一格将可使用该物品，还可通过 (Alt+1~4)快速对我方人员使用。③阵法快捷:可切换不同战法，点击后角色将会依照战法改变对应的位置。每当人物在升级后，便会学得新的法术技能。玩家可以按照自身的需求，将它们设置在快捷栏内。这样在战斗中，便可以快速进行使用，搭配出最佳的战斗组合。物品同样可以依此方式进行设置。
2、折叠战阵系统"战阵系统"说明:本作特有的战斗系统之一，战阵转变依宏氽墓指玩家于战斗中可以转变作战的核伺拈渌渴心控场角色。一、不同战阵对于玩家战斗中的加成也有所不同，战阵分别为:云行、千岳、溟心、炽神。①云行:均衡型战阵，可提升全队的速度，增强风属性防御力。《穹之扉》战斗场景②千岳:防守型战阵，可提升全队的防御力，增强土属性防御力。③溟心:回复型战阵，可提升全队的恢复能力，增强水属性防御力。④炽神:攻击型战阵，可提升全队的攻击力，增强火属性防御力。二、玩家在非战斗状态下，可对战阵设置进行组合调整。每种战阵对每个人物所增添的效果各有不同，而每个人物在同一个战阵内也有不同的战斗模式可以调整，如:防御、主攻等，玩家可根据自身需求进行设置。①司战:位于战阵的核心位置，是所有战位中可获得最高能力加成的位置。CG动画角色建模②利兵:位于战阵的侧方，可获得战位中较高的攻击能力加成。③坚盾:位于战阵的最前线，可获得战位中较高的防御能力加成，但较容易受到敌人攻击。④持援:位于战阵的最后端，可获得战位中较高的回复能力加成，且较不易受到敌人攻击。藉由此种转变，可以替整组队员提供不同的增益效果与战术运用，如此便能根据作战对象的不同，适时切换不同的作战模式，制定属于自己独特的作战计划。而当玩家在战斗中切换战阵时，并不影响当前的操控角色。若操控角色进入濒死状态，系统会依照战阵配置的角色顺序替换。
3、折叠收妖系统轩辕剑战斗中的特色系统收妖，不仅可以在战斗中将妖物收取后炼化成为实用材料，还可以炼制成为更加强大的妖怪，在战斗中作为护驾使用。但是，收妖时需要停止战斗动作才可以进行，对于玩家在战斗中的速度与体验也有着一定影响。而在本作中，这种需要暂停战斗动作才能进行的收妖操作得到了改变。玩家可在战斗中召唤出阿奇前来收妖，而阿奇的收妖动作与玩家的战斗操作相互独立且互不干涉，并不影响战斗的进行。
4、折叠护驾系统在以往《轩辕剑》游戏中，玩家在战斗中成功使用收妖系统收服的《穹之扉》主角天赋敌人，皆可以在战斗前设置为护驾，并出现在下一场战斗中。但是部分头目级别的强力敌人，要么非常难以收服，要么则是无法被收服使用。而在本次游戏中，因战斗方式的变化，护驾系统也相应做了改变与提升。玩家只要成功达成特殊任务的挑战，便可让这些头目级的怪物化身为个人护驾。游戏设置中，玩家可按照个人喜好分配设置6位护驾栏的归属，而在战场上则最多可同时存在2位护驾。每当有护驾被击退时，剩余的护驾便会依照先前设置的顺序递补上场。不仅如此，本次游戏中，护驾能够使用各种技能攻击敌人、为队伍提供各种辅助及恢复等，让玩家更轻松的进行战斗。
5、折叠天赋系统本作每位角色还具有独有的天赋，当玩家操控并发动角色独有天赋时，除了对战斗有直接性的影响外，如:降低敌方血量、给予敌方减益状态、获得特殊秘宝等。还会触发特殊的惊喜状况，如:快速闪避、不让敌人发现等。司空宇击晕:当玩家操控司空宇成功对迷宫地图上的敌人使用击晕天赋后，进入战斗时便会在所有敌人皆处于晕眩的状态下开始，我方可以快速对敌进行打击伤害，战斗事半功倍。沐月隐匿:当玩家操控沐月使用隐匿天赋后，场景内敌人便在一定时间内无法发现我们，也不会主动对我们进行追击，可快速通过场景迷宫，免去打怪耗费的时间与精力。子巧纳宝:当玩家操控子巧成功对迷宫地图上的敌人成功使用纳宝天赋后，该场战斗胜利便可以获得额外的奖励品，可能是一大笔金钱，也有可能是难得一见的法宝道具。凤煜伤袭:当玩家操控凤煜成功对敌人使用伤袭天赋后，战斗便会在所有敌人皆受到一定程度损伤的情况下开始。角色天赋资料来源
6、折叠法术技能玩家在战斗可使用的技能分为武技及浑天两种，武技为各角色独有《轩辕剑外传穹之扉》CG截图及CG模型的特色攻击技能，浑天为全角色皆可学习的法术，分别为:风、土、水、火等四系。玩家可针对即将对阵的怪物属性，在战斗前设置所使用的独特武技。人物技能系统"则分为武技及浑天两种，武技为各角色独有的特色攻击技能，浑天为角色可学习的与之相对应的属性法术，分别为:风、土、水、火等四系。玩家在非战斗状态下，可针对即将对阵的怪物属性，在战斗前设置所使用的独特武技。而"浑天"法术则需要玩家使用升级所获得的技能点数"晶元"进行学习与升级，每个人物只能学习与自身属性相符的法术，但每种浑天法术所带来的效果也各有不同，玩家可根据自身需求来分配点数，提升人物战斗各项属性与新增技能。
7、折叠锻造系统穹之扉对炼妖壶系统进行了回归式的精简，注重强化核心功能2D概念图(左)跤耧锿葡与3D游戏实际画面截图(右)，力图提升系统的实用性和易用性，让玩家在游戏进程中对该系统有更深层次的探索和应用。首先，本次的炼化机制回归系列早期设定，玩家能够更加便捷更加明确地通过炼化规则来尝试炼制新的产物。本作炼化必须采用两只战斗中收化成功的灵物来进行，炼化后的灵物各项能力数值和战场表现优于直接收化成功的灵物。特别需要注意的是，灵物之外的道具则无法应用于炼化中。其次，由于部分武器、防具类型特殊，故无法直接从商店中购买，必须使用炼妖壶的炼器功能来制作。玩家采用不同的配方炼器所得的武器或防具数值会有显著差异，炼器成功率为100%。炼器所需木材、布、丝线可以通过商店购买或者通过怪物掉落获取，而矿石、皮革、玉则只能通过怪物掉四大主角武器设定图落获取，一些珍稀的高阶材料则只有boss战才会掉落。再次，玩家通过炼妖壶系统的附魂功能可以对炼器所得的武器或防具进行附魂操作来获取额外的属性加成。通过系统炼器所得的装备皆有三个魂匣，玩家可依次选择不同属性加成的灵物对其进行附魂操作，附魂成功后被选取的灵物在炼妖壶中消失。当魂匣附满后，玩家无法再进行附魂操作，故附魂灵物的选取则需要配合人物属性和战斗需要合理选择搭配。
