1、使用药物处理鱼缸。你可以到宠物店买药，产品包装上会有详细的用法说明。不过，你得搞清楚这些药是否适用于你的鱼，尤其当你的鱼缸里还养了无脊椎的动物，如蜗牛，虾，或蛤蜊。在用药之前要经常换水，并把鱼缸里的碎石清理干净。当鱼缸干净，并且没有其它溶解掉的有机物或硝酸盐的时候，药效会更好。把过滤器里的碳拿走，因为碳会跟药物产生反应，降低药效。
2、使用铜来治疗生了白点病的海水鱼。因为海水鱼里的小瓜虫在胞囊期会持续更久，在这个时期，你可以把铜放在鱼缸里14-25天，会起到跟盐一样的作用。不过，使用铜的时候，你得一直关注用量，并用铜离子检测组件来检测鱼缸里的铜含量。记住，不能使用铜来治疗淡水鱼，因为铜对淡水鱼是有害的。按照产品说明的要求用药。把过滤器里的碳去掉，因为碳会和药起反应，影响药效。鱼缸里的石头会含有碳酸钙或碳酸镁，这些物质会和铜起反应，所以在使用铜治疗白点病的时候，要把鱼缸清空。铜对于无脊椎动物，礁石和植物都是有毒的，所以治疗的时候要把这些东西分开。
3、用更强的化学物质来治疗海水鱼的白点病。这些方法可以治疗白点病，但对于鱼是非常危险的，在使用中，你必须不停地观察，药量太大可能会把鱼儿给毒死。注意查看使用说明，并且在使用的时候穿好防护服，戴好护目镜。这些治疗方法包括：“孔雀绿”。这种方法类似于人的化疗。它在治疗白点病的时候，不仅会破坏小瓜虫的细胞，也会破坏鱼儿的细胞，使得鱼儿没法产生可供新陈代谢的能量。“福尔马林”。福尔马林一般是用来保存生物标本的，它会跟细胞的蛋白质和核酸产生反应，并杀死微生物。它还会破坏你的过滤系统，耗尽氧气，并且使鱼缸里的无脊椎动物和较弱的鱼儿危在旦夕。
