materials studio 处理分子晶体:尿素

时间:2024-10-12 16:43:06

1、打开分子晶体文档File / Import,打开输入结构对话框。Examples / Documents / 3D Model / urea.msi,单击 Import 按钮,输入urea晶体的晶胞结构。

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2、计算氢键从菜单中选择Build / Hydrogen Bonds,该涠础险渥操作会打开氢键计算对话框。注意,你可以使用不同的方案和键几何参数来计算氢键,可以产生并保台仵瑕噤存自己的方案。在此将使用默认的设置,单击Calculate按钮 。该计算也可以在Atom and Bond 工具栏上,使用Calculate Hydrogen Bond 按钮来进行计算。之后就可以关闭Hydrogen Bond Calculation 对话框。

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3、调整晶胞显示的范围在urea的3D viewer上(图中的模型窗口任意位醅呓择锗置)单击右键,在快捷菜单中打开Display Style对话框,点击Lattice 栏,将Display 部分沿X、Y、Z 轴方向的最大晶胞数(Max)改为2.0。那么现在我们就可以得到一个2x2x2 的尿素晶体了,更清楚地看到氢键。

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4、改变晶胞显示风格在Lattice 栏中,选择None,关闭对话框,将去除晶胞边界线。

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5、检查urea晶体中氢键的连接单击 Reset View 按钮(图中有个房子的样子的按钮),然后使用键盘上的上、下、左、右键,按照45°为单位旋转晶胞,观测氢键网络。

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6、关闭 urea.xsd ,按 save保存。

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