1、直饮水设备除藻：微滤机是一种截留细小悬浮物的筛网过滤装置。除藻用的微滤机多采用孔眼20～40μm的滤网，它对藻类的去除效率在40%～70%，对浮游生物的去除率可达97%～100%。此法主要用于处理低浊高藻的湖泊水。
2、气浮法除藻：在含有较多藻类和一定浊度的水中投加混凝剂，反应生成絮凝体，再用直饮水设备气浮法把絮体浮升到水面除去，可以取得远比沉淀为快的分离速度。
3、加药灭藻法：在取水湖泊或原水存贮池中定期投加硫酸铜(2～3mg/L)，可以杀灭藻类或控制其繁殖。但此法对鱼类有毒害作用。在净水工艺中采用预氯化法，可以控制藻类在净水构筑物中的生长。