48集 外交官杀人事竭惮蚕斗件(前篇)
剧情简介：某日，侦探事务所来了一名不速之客，关西高中生侦探服羿约妫鳏部平次，他此次前来是要找工藤一较高下，这时，达村外交官的夫人前来拜托小五郎调查她儿子的女友幸子，跟着夫人一起来到府邸时没想到正好碰上达村外交官被人毒杀的现场，而且这是一件密室杀人，服部找到破案线索并成功破解了密室杀人的手法，而柯南却因感冒喝下服部给他的白干酒发高烧昏倒身体异常痛苦。
49集 外交官杀人事件(后篇)
剧情简介：小兰找来医生时，却发现柯南不见了，她四处寻找来到了犯罪现场，而服部已经开始了对凶手的指认，凶手就是死者的父亲利光，他本人也主动承认，这时，工藤新一出现，他推翻了服部的推测，并对凶手重新指认，服部甘愿认输，警方带走凶手后，工藤因心痛难耐顾不上和小兰说句话就躲了起来变回柯南，休息了三天后，他意识到老白干是让他恢复原形的方法。
162集 飞天密室 工藤新一最初的事件
剧情简介：柯南、小兰和小五郎散步的时候，听到附近大楼传出女声的尖叫，闻声赶到的柯南等人发现不动产社长井本被杀，经过排查，犯人锁定在了曾经卖渔具的寺沢、来借钱的土桥和协商离婚的妻子贵子三人身上，柯南发现了凶手的法案手法后，利用简单的道具，提醒小五郎，最终犯人难逃法网。
190集 危命的复活 第三种选择
剧情简介：柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼。当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南出院后也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。死因是——氰酸钾！
191集 危命的复活 黑衣骑士
剧情简介：在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。原来由新出医生扮演的黑衣骑士却换成了……目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时意外的人物出现了！
192集 危命的复活 新一回来了
剧情简介：新一的出现圆满解决了案件。变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的瞭望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
193集 危命的复活 约定的场所
剧情简介：虽然可以确定凶手就是大场先生，但是还有两个疑点未能破解，就在新一深入调查的时候，他的身体突然一阵疼痛，药物正在渐渐失效，他强忍住即将变小的身体所带来的痛苦，坚持将案件的真相公诸于众，案件完美解决之后，新一又变回了柯南，再次的突然离开，他将如何向小兰解释？
219集 被召集的名侦探 新一 VS 怪盗基德
剧情简介：马上赶到增尾家的众人发现增尾的妻子已经被杀害了。看似是强盗杀人的事件中柯南却从中发现了疑点，经过推理最终发现了犯人的犯罪手法在。在柯南的提醒下高木警官揭露了犯人的骗局。另一方面佐藤警官拒绝了白鸟警部的邀请转而邀请高木警官一同吃饭就在这时出现的暮目警官却让高木产...
286集 工藤新一NY事件(事件篇)
剧情简介：解决了横滨中华街的命案之后，小兰突然倒地不起，在发高烧的情况下想起过去碰到的命案。那是与新一去纽约时发生的事情，有希子带他们两人一起去看话剧，在剧场门口与明星莎朗汇合后，大家一起去参观开演前的舞台陈设，不想这时却发生了意外...
287集 工藤新一NY事件(推理篇)
剧情简介：少年侦探团一大早搭乘开往米花乐园的电车，当柯南以为没人和他们一样时，就来了三个大学生也上了这趟电车，他们是铁道研究社的，来这里是为了拍摄地上电车的照片，期间，川崎下车去前方拍摄行驶的电车，可就在电车急速向前时，他突然从梯子坠落到铁轨上，幸亏司机及时刹车，他才得以保住一命，然而大家刚松了一口气，却发现堀井横尸车厢……
288集 工藤新一NY事件(解决篇)
剧情简介：之后，新一又对舞台重新进行调查，并注意到了舞台的活动机关，如果利用这个的话凶手及其犯案手法都不难推断，他将事情的真相告诉有希子，由她揭穿凶手，然而，在凶手被警方带走前却说了一句让小兰很介意的话...
572集 新一的真实身份和小兰的眼泪
剧情简介：小兰从昏迷中醒来时发现自己在一个小木屋里，并且身上的伤也被人包扎好了，这时，小五郎他们也找到了这里，服部在隔壁的房间发现了很多新线索，他把案件从新理顺后，将所有人都叫到了村长家，并指认这个用刀刺伤河内深里的人就是他身旁的工藤新一...
574集 真正想知道的事
剧情简介：一家房地产公司的黑心社长东先生和他的助手河西找到了毛利小五郎，他们称自己接到了杀人预告电话，而对方的目标就是东先生。嫌疑人有三个，小五郎和柯南一一找他们确认过，调查过程中柯南察觉到了一丝异常。三个嫌疑人被叫到了一起，柯南麻醉了小五郎后展开了推理，但就在结果出来后众人却都露出了诡异的笑容...