1、提高接诊效率，简化就医流程：电子处方系统能让医生开具电子处方时，对全院药品库存，药品规格、数量、剂型等药物信息全面了解。同时计算机自动完成划价，患者实现放心就医，为患者提供更优质的医疗服务。患者复诊时，医生可以调阅以前的病历、处方，了解其病情和用药情况，避免相互用药产生的副作用，还可以减少不同医师为同一患者重复开药的现象；电子处方取消了划价环节，减少了患者排队次数和时间。后台摆药系统可利用电子处方系统提前准备药品而缩短了患者由收费处至药房行走的时间，避免了以往患者在药房排长队时间。同时一旦药物缺少，电子处方系统也能显示，避免患者往返于诊室的现象。
2、易于辨认处方，避免差错事故：多数医生手写处方往往字迹潦草，难以辨认，致使配药时间延长，甚至容易出错。而电子处方具有字迹清晰、格式规范、易于查询等优点，减少了患者因处方出现疑问或差错而往返修改处方的麻烦，并且有利于药师配药核对，提高了配药的速度。
3、统一处方格式，规范医疗行为：运用电子处方后，医生所开处方中药品的名称、剂量及执行时间等必须严格按照要求书写，避免了处方中药品及患者等信息的遗漏，从而规范了医生的医疗行为。
4、控制处方剂量，减少医患矛盾：以往的手工处方中，医生可以随意开具药品的剂量，使用电子处方后，由于配套的用药软件对药品的剂量进行了严格的控制，一旦超过设定的剂量，医生开具处方时就会提示，并且该处方不能保存，信息不能传到收费处。一方面能使医生合理用药，药物不会多用或者少用。另一方面，也符合国家药品用量规范，从而减少医患矛盾。
