区别如下：
1、不同运营商：菜鸟站由菜鸟网牵头，为社区和校园搭建物流服务平台，妈妈站是圆通快线的一个项目。
2、效率不同：菜鸟驿站自动化程度更高，所有快递都能扫进仓库，收件代码一键发送，效率更高。母站需要多步操作，不同地区差异较大，接收和接收速度较慢。
项目背景
菜鸟网络于2013年5月28日成立，股东除了阿里巴巴、银泰、复星，还包括富春投资、顺丰和三通一达（申通、圆通、中通、韵达）等。第一期投资额达1000亿元，第二期2000亿元。阿里巴巴董事局主席马云担任菜鸟董事长。
2015年5月28日，阿里巴巴举行首届菜鸟江湖大会，菜鸟网络总裁童文红首次对外解读菜鸟战略，称菜鸟定位于“社会化物流协同、以数据为驱动力的平台”，并且明确五大战略：快递、仓配、跨境、农村和驿站。