不合法。
现行的《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规并没有赋予企业罚款权。罚款实质上是一种剥夺员工财产权的行政处罚行为，依据相关行政法律规定，只有法律授权范围内的行政机关才有行政处罚权，企业作为一种营利性组织，没有罚款权。
从《劳动法》原理来说，劳动关系是强弱对比明显的法律关系，用人单位设置罚款对劳动者是不公平的。司法实践中，劳动仲裁委和法院也大都认为用人单位无权直接对职工进行罚款，企业的多数罚款均是无效的，职工有权不予支付或讨回。
【法律法规】
《中华人民共和国劳动法》
第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《工资支付暂行规定》
第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
扩展资料：
1、“迟到罚款”的规定不合法，如果有员工遇到这样的问题，可以到劳动部门进行投诉。
2、根据《中华人民共和国劳动法》第九十一条规定：
用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
参考资料来源：中新网--“公司规定迟到一次罚100”违法 职工有权讨回